Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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