Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gtf3c1Q8K284 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gtf3c1Q8K284 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gtf3c1Q8K284 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gtf3c1Q8K284 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gtf3c1Q8K284 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gtf3c1Q8K284 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gtf3c1Q8K284 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gtf3c1Q8K284 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gtf3c1Q8K284 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gtf3c1Q8K284 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gtf3c1Q8K284 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Gtf3c1Q8K284 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gtf3c1Q8K284 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gtf3c1Q8K284 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gtf3c1Q8K284 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gtf3c1Q8K284 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gtf3c1Q8K284 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gtf3c1Q8K284 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gtf3c1Q8K284 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gtf3c1Q8K284 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gtf3c1Q8K284 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gtf3c1Q8K284 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gtf3c1Q8K284 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gtf3c1Q8K284 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gtf3c1Q8K284 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gtf3c1Q8K284 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gtf3c1Q8K284 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gtf3c1Q8K284 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gtf3c1Q8K284 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gtf3c1Q8K284 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gtf3c1Q8K284 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gtf3c1Q8K284 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gtf3c1Q8K284 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gtf3c1Q8K284 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gtf3c1Q8K284 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gtf3c1Q8K284 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gtf3c1Q8K284 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gtf3c1Q8K284 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gtf3c1Q8K284 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gtf3c1Q8K284 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gtf3c1Q8K284 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gtf3c1Q8K284 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gtf3c1Q8K284 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gtf3c1Q8K284 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gtf3c1Q8K284 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gtf3c1Q8K284 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gtf3c1Q8K284 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gtf3c1Q8K284 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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