Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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