Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Trim68Q8K243 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Trim68Q8K243 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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