Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nek9Q8K1R7 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nek9Q8K1R7 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nek9Q8K1R7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nek9Q8K1R7 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nek9Q8K1R7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nek9Q8K1R7 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nek9Q8K1R7 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nek9Q8K1R7 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nek9Q8K1R7 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Nek9Q8K1R7 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nek9Q8K1R7 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Nek9Q8K1R7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nek9Q8K1R7 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nek9Q8K1R7 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nek9Q8K1R7 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nek9Q8K1R7 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nek9Q8K1R7 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Nek9Q8K1R7 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nek9Q8K1R7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nek9Q8K1R7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nek9Q8K1R7 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nek9Q8K1R7 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nek9Q8K1R7 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nek9Q8K1R7 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nek9Q8K1R7 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nek9Q8K1R7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nek9Q8K1R7 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nek9Q8K1R7 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nek9Q8K1R7 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nek9Q8K1R7 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nek9Q8K1R7 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nek9Q8K1R7 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Nek9Q8K1R7 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nek9Q8K1R7 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nek9Q8K1R7 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Nek9Q8K1R7 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nek9Q8K1R7 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nek9Q8K1R7 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nek9Q8K1R7 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nek9Q8K1R7 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nek9Q8K1R7 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nek9Q8K1R7 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Nek9Q8K1R7 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nek9Q8K1R7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nek9Q8K1R7 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nek9Q8K1R7 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nek9Q8K1R7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nek9Q8K1R7 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nek9Q8K1R7 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nek9Q8K1R7 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nek9Q8K1R7 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nek9Q8K1R7 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nek9Q8K1R7 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nek9Q8K1R7 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nek9Q8K1R7 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nek9Q8K1R7 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nek9Q8K1R7 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nek9Q8K1R7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nek9Q8K1R7 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nek9Q8K1R7 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Nek9Q8K1R7 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Nek9Q8K1R7 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nek9Q8K1R7 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nek9Q8K1R7 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nek9Q8K1R7 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nek9Q8K1R7 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Nek9Q8K1R7 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nek9Q8K1R7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nek9Q8K1R7 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nek9Q8K1R7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nek9Q8K1R7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nek9Q8K1R7 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nek9Q8K1R7 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nek9Q8K1R7 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms