Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms