Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Cldn34c1Q8K193 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Cldn34c1Q8K193 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Cldn34c1Q8K193 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Cldn34c1Q8K193 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Cldn34c1Q8K193 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Cldn34c1Q8K193 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Cldn34c1Q8K193 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Cldn34c1Q8K193 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms