Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mterf1aQ8CHZ9 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mterf1aQ8CHZ9 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Mterf1aQ8CHZ9 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Mterf1aQ8CHZ9 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mterf1aQ8CHZ9 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Mterf1aQ8CHZ9 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mterf1aQ8CHZ9 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mterf1aQ8CHZ9 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mterf1aQ8CHZ9 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Mterf1aQ8CHZ9 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Mterf1aQ8CHZ9 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mterf1aQ8CHZ9 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mterf1aQ8CHZ9 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mterf1aQ8CHZ9 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mterf1aQ8CHZ9 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms