Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms