Protein–RNA interactions for Protein: Q8CF98

Colec10, Collectin-10, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec10Q8CF98 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
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Colec10Q8CF98 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Colec10Q8CF98 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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