Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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