Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pramef8Q8CE24 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pramef8Q8CE24 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pramef8Q8CE24 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pramef8Q8CE24 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pramef8Q8CE24 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pramef8Q8CE24 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pramef8Q8CE24 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pramef8Q8CE24 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pramef8Q8CE24 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pramef8Q8CE24 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pramef8Q8CE24 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pramef8Q8CE24 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pramef8Q8CE24 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pramef8Q8CE24 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pramef8Q8CE24 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pramef8Q8CE24 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pramef8Q8CE24 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pramef8Q8CE24 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pramef8Q8CE24 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pramef8Q8CE24 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pramef8Q8CE24 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pramef8Q8CE24 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pramef8Q8CE24 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pramef8Q8CE24 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pramef8Q8CE24 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pramef8Q8CE24 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Pramef8Q8CE24 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Pramef8Q8CE24 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Pramef8Q8CE24 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Pramef8Q8CE24 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms