Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCT7

Nsun3, tRNA (cytosine(34)-C(5))-methyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsun3Q8CCT7 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nsun3Q8CCT7 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms