Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms