Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms