Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms