Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm8023-201ENSMUST00000195298 903 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Gm43821-201ENSMUST00000199198 729 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Glipr1l3-201ENSMUST00000220085 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 AC109214.2-201ENSMUST00000220089 358 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 AC163354.2-201ENSMUST00000221741 649 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Olfr791-201ENSMUST00000057477 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 4930440C22Rik-201ENSMUST00000185490 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Gm14413-201ENSMUST00000122158 408 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Gm8624-202ENSMUST00000165677 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Gm44760-201ENSMUST00000206375 1173 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Ssxb2-201ENSMUST00000023931 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Eqtn-201ENSMUST00000030309 1074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Cldn34b3-201ENSMUST00000096389 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Gm10610-203ENSMUST00000208877 1206 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Gm6657-204ENSMUST00000211288 1091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 AC096628.1-201ENSMUST00000226060 641 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Gm37370-201ENSMUST00000191996 1410 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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