Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Pggt1bQ8BUY9 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Pggt1bQ8BUY9 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Pggt1bQ8BUY9 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Pggt1bQ8BUY9 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Pggt1bQ8BUY9 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Pggt1bQ8BUY9 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Pggt1bQ8BUY9 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Pggt1bQ8BUY9 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Pggt1bQ8BUY9 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Pggt1bQ8BUY9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Pggt1bQ8BUY9 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Pggt1bQ8BUY9 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Pggt1bQ8BUY9 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Pggt1bQ8BUY9 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Pggt1bQ8BUY9 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Pggt1bQ8BUY9 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Pggt1bQ8BUY9 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Pggt1bQ8BUY9 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Pggt1bQ8BUY9 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Pggt1bQ8BUY9 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Pggt1bQ8BUY9 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Pggt1bQ8BUY9 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Pggt1bQ8BUY9 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Pggt1bQ8BUY9 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Pggt1bQ8BUY9 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Pggt1bQ8BUY9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms