Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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Nop53Q8BK35 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Nop53Q8BK35 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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