Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms