Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp4f39Q8BGU0 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp4f39Q8BGU0 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms