Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms