Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms