Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Lrfn4Q80XU8 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrfn4Q80XU8 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrfn4Q80XU8 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrfn4Q80XU8 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrfn4Q80XU8 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrfn4Q80XU8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrfn4Q80XU8 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrfn4Q80XU8 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Lrfn4Q80XU8 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Lrfn4Q80XU8 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Lrfn4Q80XU8 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Lrfn4Q80XU8 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
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Lrfn4Q80XU8 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Lrfn4Q80XU8 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Lrfn4Q80XU8 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrfn4Q80XU8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrfn4Q80XU8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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