Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms