Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms