Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma8aQ80VM8 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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