Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms