Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Tnfsf18Q7TS55 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
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Tnfsf18Q7TS55 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Tnfsf18Q7TS55 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Tnfsf18Q7TS55 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Tnfsf18Q7TS55 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Tnfsf18Q7TS55 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Tnfsf18Q7TS55 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Tnfsf18Q7TS55 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Tnfsf18Q7TS55 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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