Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms