Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf139Q7TMV1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms