Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms