Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms