Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR1

Cfap97, Cilia- and flagella-associated protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap97Q6ZPR1 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap97Q6ZPR1 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap97Q6ZPR1 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap97Q6ZPR1 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap97Q6ZPR1 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap97Q6ZPR1 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap97Q6ZPR1 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap97Q6ZPR1 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap97Q6ZPR1 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap97Q6ZPR1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap97Q6ZPR1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap97Q6ZPR1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap97Q6ZPR1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap97Q6ZPR1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap97Q6ZPR1 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap97Q6ZPR1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap97Q6ZPR1 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap97Q6ZPR1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms