Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAR7

Ssxb10, MCG68110, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb10Q6XAR7 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
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Ssxb10Q6XAR7 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Ssxb10Q6XAR7 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Ssxb10Q6XAR7 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Ssxb10Q6XAR7 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Ssxb10Q6XAR7 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Ssxb10Q6XAR7 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Ssxb10Q6XAR7 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Ssxb10Q6XAR7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Ssxb10Q6XAR7 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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