Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cxcl3Q6W5C0 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cxcl3Q6W5C0 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcl3Q6W5C0 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcl3Q6W5C0 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcl3Q6W5C0 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcl3Q6W5C0 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcl3Q6W5C0 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcl3Q6W5C0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcl3Q6W5C0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcl3Q6W5C0 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcl3Q6W5C0 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcl3Q6W5C0 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcl3Q6W5C0 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcl3Q6W5C0 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcl3Q6W5C0 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcl3Q6W5C0 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcl3Q6W5C0 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcl3Q6W5C0 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcl3Q6W5C0 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcl3Q6W5C0 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcl3Q6W5C0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcl3Q6W5C0 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcl3Q6W5C0 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcl3Q6W5C0 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcl3Q6W5C0 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcl3Q6W5C0 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcl3Q6W5C0 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcl3Q6W5C0 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcl3Q6W5C0 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcl3Q6W5C0 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcl3Q6W5C0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcl3Q6W5C0 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcl3Q6W5C0 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcl3Q6W5C0 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcl3Q6W5C0 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcl3Q6W5C0 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcl3Q6W5C0 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcl3Q6W5C0 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcl3Q6W5C0 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcl3Q6W5C0 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcl3Q6W5C0 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcl3Q6W5C0 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cxcl3Q6W5C0 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cxcl3Q6W5C0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cxcl3Q6W5C0 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cxcl3Q6W5C0 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cxcl3Q6W5C0 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cxcl3Q6W5C0 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cxcl3Q6W5C0 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cxcl3Q6W5C0 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cxcl3Q6W5C0 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cxcl3Q6W5C0 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cxcl3Q6W5C0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cxcl3Q6W5C0 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cxcl3Q6W5C0 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cxcl3Q6W5C0 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cxcl3Q6W5C0 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms