Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH4

Gcsam, Germinal center-associated signaling and motility protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcsamQ6RFH4 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
GcsamQ6RFH4 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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