Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SvoplQ6PDF3 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SvoplQ6PDF3 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SvoplQ6PDF3 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SvoplQ6PDF3 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SvoplQ6PDF3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SvoplQ6PDF3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SvoplQ6PDF3 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SvoplQ6PDF3 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SvoplQ6PDF3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SvoplQ6PDF3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SvoplQ6PDF3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SvoplQ6PDF3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SvoplQ6PDF3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SvoplQ6PDF3 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SvoplQ6PDF3 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SvoplQ6PDF3 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SvoplQ6PDF3 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SvoplQ6PDF3 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SvoplQ6PDF3 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SvoplQ6PDF3 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SvoplQ6PDF3 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SvoplQ6PDF3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SvoplQ6PDF3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SvoplQ6PDF3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SvoplQ6PDF3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SvoplQ6PDF3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SvoplQ6PDF3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SvoplQ6PDF3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SvoplQ6PDF3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SvoplQ6PDF3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SvoplQ6PDF3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SvoplQ6PDF3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SvoplQ6PDF3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SvoplQ6PDF3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SvoplQ6PDF3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SvoplQ6PDF3 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SvoplQ6PDF3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SvoplQ6PDF3 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SvoplQ6PDF3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SvoplQ6PDF3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SvoplQ6PDF3 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SvoplQ6PDF3 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SvoplQ6PDF3 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SvoplQ6PDF3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SvoplQ6PDF3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SvoplQ6PDF3 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SvoplQ6PDF3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SvoplQ6PDF3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SvoplQ6PDF3 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SvoplQ6PDF3 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SvoplQ6PDF3 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SvoplQ6PDF3 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SvoplQ6PDF3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SvoplQ6PDF3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SvoplQ6PDF3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SvoplQ6PDF3 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SvoplQ6PDF3 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SvoplQ6PDF3 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SvoplQ6PDF3 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SvoplQ6PDF3 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SvoplQ6PDF3 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SvoplQ6PDF3 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SvoplQ6PDF3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SvoplQ6PDF3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SvoplQ6PDF3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SvoplQ6PDF3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SvoplQ6PDF3 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SvoplQ6PDF3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SvoplQ6PDF3 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SvoplQ6PDF3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms