Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim37Q6PCX9 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms