Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms