Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms