Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Tpm4Q6IRU2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
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Tpm4Q6IRU2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Tpm4Q6IRU2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Tpm4Q6IRU2 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Tpm4Q6IRU2 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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