Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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