Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms