Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms