Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nop58Q6DFW4 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nop58Q6DFW4 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Nop58Q6DFW4 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Nop58Q6DFW4 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Nop58Q6DFW4 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nop58Q6DFW4 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nop58Q6DFW4 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nop58Q6DFW4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nop58Q6DFW4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nop58Q6DFW4 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nop58Q6DFW4 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nop58Q6DFW4 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Nop58Q6DFW4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nop58Q6DFW4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nop58Q6DFW4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nop58Q6DFW4 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nop58Q6DFW4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nop58Q6DFW4 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nop58Q6DFW4 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nop58Q6DFW4 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nop58Q6DFW4 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nop58Q6DFW4 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nop58Q6DFW4 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Nop58Q6DFW4 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nop58Q6DFW4 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nop58Q6DFW4 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms