Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzrn3Q69ZS0 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzrn3Q69ZS0 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzrn3Q69ZS0 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzrn3Q69ZS0 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzrn3Q69ZS0 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzrn3Q69ZS0 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzrn3Q69ZS0 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzrn3Q69ZS0 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzrn3Q69ZS0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Pdzrn3Q69ZS0 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Pdzrn3Q69ZS0 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Pdzrn3Q69ZS0 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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