Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE8

Znf280d, Zinc finger protein 280D, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf280dQ68FE8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Znf280dQ68FE8 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Znf280dQ68FE8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Znf280dQ68FE8 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf280dQ68FE8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf280dQ68FE8 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf280dQ68FE8 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf280dQ68FE8 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf280dQ68FE8 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf280dQ68FE8 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf280dQ68FE8 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf280dQ68FE8 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf280dQ68FE8 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf280dQ68FE8 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf280dQ68FE8 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf280dQ68FE8 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf280dQ68FE8 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf280dQ68FE8 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf280dQ68FE8 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf280dQ68FE8 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf280dQ68FE8 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf280dQ68FE8 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf280dQ68FE8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf280dQ68FE8 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf280dQ68FE8 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf280dQ68FE8 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf280dQ68FE8 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf280dQ68FE8 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf280dQ68FE8 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf280dQ68FE8 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf280dQ68FE8 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf280dQ68FE8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms