Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD7

Fnip1, Folliculin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fnip1Q68FD7 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fnip1Q68FD7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms