Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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PtprdQ64487 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PtprdQ64487 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprdQ64487 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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